Al cambiar la placa Anet a1 por arduino+ramps tengo una pequeña diferencia en los eljes X e Y, los pasos son los mismos en los dos ejes y me pregunto si puede ser por diferencias en los ajustes de corriente en los drivers.
Y en uno frene mas en seco que el otro.
Que os parece?.

Hola, la razones para esa diferencia en las medidas de un eje respecto al otro son varias, debidas tanto a la parte mecánica como a la electrónica.
Eso sí, no debería haber mucha diferencia de uno al otro. Si es grande, puede ser que haya pérdida de pasos en alguno de los ejes.
Si todo funciona correctamente no te preocupes, ya que los ejes no tienen por qué tener configurados los mismos pasos por milímetro.
Calíbralos correctamente y pon en cada uno los que le correspondan.